Элемент ответа трансактивации (TAR) - Trans-activation response element (TAR)

Элемент ответа трансактивации (TAR)
RF00250.jpg
Идентификаторы
Символмир-ТАР
Альт. СимволыТАР
РфамRF00250
Прочие данные
РНК типГен; miRNA
Домен (ы)Вирусы
ИДТИТермин GO должен начинаться с GO: Термин GO должен начинаться с GO:
ТАКТАК: 0000233 SO: 0001244
PDB структурыPDBe

В ВИЧ элемент трансактивационного ответа (TAR) является Элемент РНК который, как известно, необходим для трансактивации вирусного промоутер и для репликации вирусов. ТАР заколка для волос это динамическая структура[1] который действует как связывающий сайт для Белок Tat, и это взаимодействие стимулирует активность длинный терминальный повтор промоутер.[2]

Дальнейший анализ показал, что TAR - это пре-микроРНК который продуцирует зрелые микроРНК из обеих цепей стволовой петли TAR.[3]Считается, что эти miRNA предотвращают заражение инфицированных клеток. апоптоз к подавление гены ERCC1, IER3,[4] CDK9, и Бим.[5]

Рекомендации

  1. ^ Лу, Цзя; Kadakkuzha, Beena M .; Чжао, Лян; и другие. (2011). "Динамическое ансамблевое представление конформационного ландшафта РНК ВИЧ-1 TAR и аллостерического распознавания". Биохимия. 50 (22): 5042–5057. Дои:10.1021 / bi200495d. PMID  21553929.
  2. ^ Кулинский, Т; Олейничак М; Huthoff H; Bielecki L; Пачульска-Вечорек К; Das AT; Беркхоут Б; Адамиак RW (2003). «Апикальная петля шпильки TAR РНК ВИЧ-1 стабилизирована парой оснований с перекрестной петлей». J Biol Chem. 278 (40): 38892–38901. Дои:10.1074 / jbc.M301939200. PMID  12882959.
  3. ^ Уэлле Д.Л., Планте I, Ландри П. и др. (Апрель 2008 г.). «Идентификация функциональных микроРНК, высвобождаемых посредством асимметричного процессинга TAR-элемента ВИЧ-1». Нуклеиновые кислоты Res. 36 (7): 2353–2365. Дои:10.1093 / nar / gkn076. ЧВК  2367715. PMID  18299284.
  4. ^ Класе З., Виноград Р., Дэвис Дж. И др. (2009). «МИРНК TAR ВИЧ-1 защищает от апоптоза, изменяя экспрессию клеточных генов». Ретровирология. 6: 18. Дои:10.1186/1742-4690-6-18. ЧВК  2654423. PMID  19220914.
  5. ^ Нараянан, А; Иорданский, С; Das, R; Ван Дайн, Р. Сантос, S; Яворски, Э; Гендель, я; Sampey, G; Dalby, E; Иглесиас-Уссель, М; Попратилов, А; Hakami, R; Кен-Холл, К; Янг, М; Subra, C; Гилберт, C; Бейли, К; Ромерио, Ф; Кашанчи, Ф (5 июля 2013 г.). «Экзосомы, полученные из ВИЧ-1-инфицированных клеток, содержат РНК элемента ответа на трансактивацию». Журнал биологической химии. 288 (27): 20014–20033. Дои:10.1074 / jbc.m112.438895. ЧВК  3707700. PMID  23661700.

внешняя ссылка